Sau khi thi đấu thành công trong màu áo các đội trẻ của Hà Nội, Mạch Ngọc Hà được đôn lên đội một ở mùa giải 2019. Tuy nhiên, anh không có nhiều cơ hội ra sân cho đội một và được đem cho Phù Đổng và Quảng Nam mượn để tích lũy kinh nghiệm.[2]

Ngày 5 tháng 2 năm 2023, Ngọc Hà có trận đấu đầu tiên tại V.League 1 khi vào sân thay người trong trận gặp Viettel.